Un brote de enfermedad inflamatoria inestinal puede reconocerse cuando los pacientes presentan sangrado rectal, moco o tenesmo; sin embargo, los síntomas gastrointestinales inespecíficos como el dolor abdominal difuso o los hábitos intestinales alterados no siempre reflejan un brote. 

El tratamiento para la enfermedad activa exige la optimización de la terapia, ya sea con la escalada de medicamentos antiinflamatorios, como inmunomoduladores y agentes biológicos o cirugía. Hay varias afecciones que deben excluirse en un paciente con enfermedad inflamatoria intestinal que presenta diarrea persistente a pesar del control relativo de la inflamación.

La siguiente tabla (Sintomas grastointestinales en pacientes con EII) resume las presentaciones clínicas que puede presentar un paciente y la enfermedad con la que podría relacionarse.